基因表觀遺傳學癌症檢測技術概述

高通量5hmC DNA羥甲基化癌症檢測技術簡介


技術優勢
技術對比

下表列出了高通量5hmC DNA羥甲基化檢測技術與現有腫瘤液體活檢技術以及現有血液基因測序平台技術參數之間的比較,兩組比較均凸顯了TED檢測在腫瘤檢測中的優勢。


  與液體活檢平台比較


液體活檢平台
蛋白腫瘤標記物
CTC 草莓榴社区在线视频高通量5hmc DNA羥甲基化檢測
檢測範圍 特異性癌症 肺癌 各種類型的癌症
敏感度 <60% 67% >90%
組織特異性
較弱 較強 明確區分
血液需求
<2mL >5mL 8mL
分期檢測
中晚期 中晚期 早中晚期


  與現有血液基因測序平台技術參數對比


技術
甲基化Septin9檢測
基因突變 草莓榴社区在线视频高通量5hmc DNA羥甲基化檢測
基因檢測區域 啟動子CpG區域 外顯子突變 啟動子區域和基因功能區域
檢測基因位點數 1個基因啟動子區域 多個突變位點 >17000個基因
基因檢測方法
qPCR 基於Panel的高通量測序 高通量測序
敏感性/特異性
75%/85% ~60%/>90% >90%/>90%
組織特異性
腫瘤分期檢測能力 早期 中晚期 早中晚期
癌症主要應用範圍 腸癌篩查 用藥指導 多種癌症篩查、預後複查
公司技術主要文獻
作  者
期  刊
影 響 因 子
Song C. et al. Nat. Biotechnol. 2011, 29, 68-72 41.67
Song C. et al.
Nat. Methods. 2011, 9, 75-77 25.06
Szulwach K. et al.
Nat. Neurosci. 2011, 14, 1607-1616 17.84
Yu M. et al.
Cell. 2012, 149, 1368-1380 30.41
Song C. et al.
Cell. 2013, 153, 678-691 30.41
Wang T. et al.
Nat. Cell. Biol. 2013 20.06
Jiang L. et al. Cell. 2013, 153, 773-784 30.41
Jeong M. et al. Nat. Genet. 2014, 46, 17-23 27.96
Wang L. et al. Cell. 2014, 157, 979-991 30.41
Feng J. et al. Nat. Neurosci. 2015, 18, 536-544 17.84
Xia B. et al. Nat. Methods. 2015, 12, 1047-1050 25.06
Han et al. Mol. Cell. 2016, 63, 1‒9 14.71
Song C. et al. Cell Res. 2017, 27(10):1231-42 15.61
Li W. et al. Cell Res. 2017, 27(10):1243 15.61
Tian X. et al. Cell Res. 2018, 0:1-4 15.61
檢測流程

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第一步.5hmC信號捕獲:通過草莓视频成年版app色斑全球獨家專利的化學標記捕獲技術可特異性富集全基因組近2萬個含有5hmC修飾的基因片段。

第二步.二代測序:對富集到的基因片段進行二代測序,獲得全基因組5hmC的分布和含量。

第三步.機器學習和建模分析:通過收集、檢測上萬人的血液樣本建立屬於中國人特征的數據庫信息,有針對性的對中國健康人群和不同癌症的人群進行係統全基因組信息分析。

第四步.生成數據與發送報告:通過大數據對比找出癌症人群中特異的 5hmC 信號,並通過機器學習的方法建立癌症預測模型,以及獨立樣本加以驗證。生產部收到樣本後10個工作日內發送報告。


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延伸閱讀——基因表觀遺傳學與全基因組測序知識

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